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Im Rahmen der Biotopkartierung (BK) Bayern werden ausgebildete Fachleute vom Bayerischen Landesamt für Umwelt (LfU) beauftragt, die in der Landschaft vorhandenen Biotope zu dokumentieren. Dabei werden nicht nur die Biotopflächen abgegrenzt und einem der 143 in Bayern vorkommenden Biotoptypen zugeordnet, sondern auch die vorkommenden Pflanzenarten notiert und ihr aktueller Zustand bewertet. Da in Bayern geschätzt über 414.170 Hektar an Biotopflächen vorhanden sind, was etwa 5,9 % der Landesfläche Bayerns entspricht, dauert eine einmalige bayernweite Bestandsaufnahme ungefähr 15 bis 20 Jahre.
Dass so eine Kartierung wichtig ist, zeigt sich auf vielfache Art: So ermöglicht das Wissen, wo und in welchem Zustand ein Biotop ist, beispielsweise eine zielgerichtete Förderung der Grundstückseigentümer. Denn oft haben siedurch ihre Bewirtschaftung den Lebensraum erst zu einem Schmuckstück der Landschaft gemacht. Auch können Baumaßnahmen besser entwickelt werden, wenn Ingenieure und Architekten die sensiblen Bereiche der Natur kennen und so in ihrer Planung berücksichtigen können.